Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCK1Q08629 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms