Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
POLEQ07864 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
POLEQ07864 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
POLEQ07864 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
POLEQ07864 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
POLEQ07864 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
POLEQ07864 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
POLEQ07864 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
POLEQ07864 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.03
POLEQ07864 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
POLEQ07864 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
POLEQ07864 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
POLEQ07864 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
POLEQ07864 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
POLEQ07864 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
POLEQ07864 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
POLEQ07864 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
POLEQ07864 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
POLEQ07864 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
POLEQ07864 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
POLEQ07864 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
POLEQ07864 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
POLEQ07864 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
POLEQ07864 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
POLEQ07864 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
POLEQ07864 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
POLEQ07864 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
POLEQ07864 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
POLEQ07864 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms