Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN1BQ07699 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCN1BQ07699 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms