Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP1-1Q07627 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms