Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DEUP1Q05D60 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms