Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN12Q05209 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms