Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMX2Q04743 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms