Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
IRF9Q00978 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms