Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms