Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms