Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME5P56597 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME5P56597 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME5P56597 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME5P56597 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME5P56597 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME5P56597 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME5P56597 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME5P56597 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME5P56597 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME5P56597 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NME5P56597 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NME5P56597 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NME5P56597 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NME5P56597 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms