Protein–RNA interactions for Protein: P51164

ATP4B, Potassium-transporting ATPase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4BP51164 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP4BP51164 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP4BP51164 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms