Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYB561P49447 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYB561P49447 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYB561P49447 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYB561P49447 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYB561P49447 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYB561P49447 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYB561P49447 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYB561P49447 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYB561P49447 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYB561P49447 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYB561P49447 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYB561P49447 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYB561P49447 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYB561P49447 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYB561P49447 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYB561P49447 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYB561P49447 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYB561P49447 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYB561P49447 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CYB561P49447 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms