Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms