Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXC13P31276 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms