Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA9P31269 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms