Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD40LGP29965 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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