Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP1P29466 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP1P29466 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP1P29466 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP1P29466 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP1P29466 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP1P29466 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP1P29466 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP1P29466 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP1P29466 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP1P29466 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASP1P29466 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASP1P29466 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASP1P29466 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASP1P29466 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASP1P29466 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASP1P29466 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CASP1P29466 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CASP1P29466 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms