Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms