Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO2P25791 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO2P25791 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO2P25791 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO2P25791 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO2P25791 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO2P25791 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO2P25791 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO2P25791 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO2P25791 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO2P25791 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO2P25791 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO2P25791 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO2P25791 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO2P25791 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMO2P25791 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMO2P25791 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms