Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKCHP24723 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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