Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GADD45AP24522 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GADD45AP24522 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GADD45AP24522 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GADD45AP24522 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GADD45AP24522 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms