Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCMT1P22061 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCMT1P22061 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCMT1P22061 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCMT1P22061 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCMT1P22061 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCMT1P22061 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCMT1P22061 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCMT1P22061 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCMT1P22061 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCMT1P22061 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCMT1P22061 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCMT1P22061 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCMT1P22061 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCMT1P22061 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms