Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
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PTPRAP18433 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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PTPRAP18433 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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PTPRAP18433 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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PTPRAP18433 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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PTPRAP18433 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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PTPRAP18433 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRAP18433 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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