Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFAP13804 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFAP13804 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFAP13804 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFAP13804 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFAP13804 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFAP13804 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFAP13804 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFAP13804 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFAP13804 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFAP13804 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFAP13804 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFAP13804 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFAP13804 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFAP13804 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFAP13804 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFAP13804 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETFAP13804 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETFAP13804 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETFAP13804 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETFAP13804 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETFAP13804 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETFAP13804 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETFAP13804 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETFAP13804 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETFAP13804 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETFAP13804 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETFAP13804 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFAP13804 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFAP13804 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFAP13804 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFAP13804 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFAP13804 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFAP13804 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms