Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEPDP12955 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEPDP12955 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEPDP12955 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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