Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms