Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3P10147 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3P10147 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3P10147 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms