Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD3P0DMS9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms