Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOA1P02647 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOA1P02647 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOA1P02647 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOA1P02647 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOA1P02647 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOA1P02647 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOA1P02647 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOA1P02647 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOA1P02647 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOA1P02647 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOA1P02647 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOA1P02647 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOA1P02647 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOA1P02647 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOA1P02647 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOA1P02647 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms