Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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ZBED1O96006 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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ZBED1O96006 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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ZBED1O96006 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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ZBED1O96006 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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ZBED1O96006 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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