Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN9O95484 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms