Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NIPSNAP2O75323 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms