Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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