Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF4O60810 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms