Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRODHO43272 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRODHO43272 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRODHO43272 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRODHO43272 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRODHO43272 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRODHO43272 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRODHO43272 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRODHO43272 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRODHO43272 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRODHO43272 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRODHO43272 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRODHO43272 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRODHO43272 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRODHO43272 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRODHO43272 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRODHO43272 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRODHO43272 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRODHO43272 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRODHO43272 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRODHO43272 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRODHO43272 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRODHO43272 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRODHO43272 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRODHO43272 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRODHO43272 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRODHO43272 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRODHO43272 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRODHO43272 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRODHO43272 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRODHO43272 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRODHO43272 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRODHO43272 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRODHO43272 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRODHO43272 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRODHO43272 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRODHO43272 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRODHO43272 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRODHO43272 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRODHO43272 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRODHO43272 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRODHO43272 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRODHO43272 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRODHO43272 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRODHO43272 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRODHO43272 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRODHO43272 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRODHO43272 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRODHO43272 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRODHO43272 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRODHO43272 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRODHO43272 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRODHO43272 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRODHO43272 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRODHO43272 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRODHO43272 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRODHO43272 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRODHO43272 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRODHO43272 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRODHO43272 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms