Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms