Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
USP17L12C9JPN9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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USP17L12C9JPN9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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USP17L12C9JPN9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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USP17L12C9JPN9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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USP17L12C9JPN9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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USP17L12C9JPN9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
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USP17L12C9JPN9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP17L12C9JPN9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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