Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms