Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF22A3QJZ6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF22A3QJZ6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF22A3QJZ6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF22A3QJZ6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF22A3QJZ6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF22A3QJZ6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF22A3QJZ6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF22A3QJZ6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF22A3QJZ6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF22A3QJZ6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF22A3QJZ6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF22A3QJZ6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF22A3QJZ6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF22A3QJZ6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms