Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms