Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TPRKBQ9Y3C4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TPRKBQ9Y3C4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms