Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG6Q9Y2V7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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