Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAPRE3Q9UPY8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms