Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPC1L1Q9UHC9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPC1L1Q9UHC9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms