Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MLH3Q9UHC1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms