Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms