Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABI3Q9P2A4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms