Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms