Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms